Співробітники СБУ підозрюють його в розтраті грошових коштів державного підприємства на суму понад 1 мільйон гривень. За Кримінальним кодексом йому загрожує строк від 7 до 12 років, оскільки сума в 1 мільйон - особливо великий розмір розтрати.

На даний момент Олександр Худенко поміщений в ізолятор тимчасового утримання УМВСУ в Харківській області, з ним проводяться слідчі дії.